生物信息與藥物設計實驗室,香港浸會大學岑堯寬岑碧泉紀念癌症炎症研究中心

发布日期：2025-01-04 17:36    点击次数：169

生物信息學與藥物設計實驗室提供了一個集成的生物信息學分析和藥物設計平台，側重於以下五個方面：構建一個全面和大型的生物醫學數據倉庫;數據挖掘技術提 取，從大量的生物學數據中提取有用的結果;承擔組學分析，包括蛋白質組學和代謝組學;處理用於存儲，檢索和分析生物數據的方法，如核酸和蛋白質序列，結構，功能，通路和遺傳相互作用的方法﹔使用生物信息學工具進行計算機輔助藥物設計（ CADD ）技術研究。Ø生物醫學數據庫我們收集整合多種層面的生物醫學數據庫的信息構建了生物醫學數據庫。現有的生物醫學數據庫包括SinoMed, PubMed, OMIM, GO, NCI pathway interaction database, MeSH, PubChem, TCMDB, PDB, ChEMBL, PharmaGKB, TTD, DrugBank, UniProt, UMLS 和 KEGG.Ø數據挖掘基於生物醫學數據庫，典型的文本挖掘任務包括文本分類，文本聚類，概念/實體抽取，情感分析和文件總結以從這些文本數據獲取高質量信息。Ø蛋白質組和代謝組分析該實驗室提供了一個全面的蛋白組學和代謝物組學分析平台。氣相色譜（GC）和高效液相色譜（HPLC）這兩種廣泛使用的方法被用於實驗室中。此外，質譜（MS ）被用於定量HPLC和GC分離後的代謝產物。一些統計學軟件被用於MS的數據分析。Ø生物信息學分析通過應用計算密集型技術，我們開發了新的算法和統計方法，用以評估的大數據集的成員之間的關系，以增加對生物過程的理解。一些商業軟件，比如ingenuity pathway analysis (IPA)也被用於網絡分析，比較分析，上游調控因子分析，機械網絡和通路分析。Ø計算機輔助藥物設計基於對小分子，蛋白質，和核酸機構的理解，我們使用計算機輔助藥物設計技術（CADD）來發現和設計用於治療的活性分子。為了進一步理解藥物/藥物組合在生物網絡中作用機制，我們發展了基於結構的技術以識別藥物/藥物組合的分子靶點。